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who_is_lier
- 传说在世界的某个角落里,有着这样二个怪异的民族,诚实族与说谎族。诚实族的人永远说真话,而说谎族的人永远说假话。为了能够真正了解这二个民族,生物信息学小组全体成员在老师的带领下一行6人决定冒险前往这二个地方。在快要到达目的地的途中遇到了三个人,知道他们可能是来自诚实族或说谎族的。老师分别问了他们的问题。问第一个人:“你们是什么族?”,答:“我们之中有两个来自诚实族。”第二个人说:“不要胡说,我们三个人中只有一个是诚实族的。”第三个人听了第二个人的话后说:“对,就是只有一个诚实族的。”当听完这些人的
search_genome
- 一个自制的生物信息学程序。 这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。 程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
test
- 生物信息学中文件处理的程序是其它软件需求格式的基础
NLP.tools.for.biology.slides
- 介绍自然语言处理工具在生物信息学领域的应用的ppt.作者为uiuc博士生。
batchDnaWalk
- 生物信息学实用工具 批量绘制DNAWalk图形的Perl程序源码 内含使用说明 用基因组DNA序列批量绘制DNAWalk。
globalblast2
- 实现一个生物信息学上面的blast的比对,有很好的借鉴作用,希望对大家有帮助
bioinfomatics
- 《生物信息学》现在模式识别应用的一个重要方向。希望可以给大家有点作用!
DOTUR
- 用于划分OTU(operation taxonomic unit),输入数据为DNA序列的距离矩阵,输出为各个水平上OTU的划分情况,以及evenness,richness,diversity index的计算值。可用于文库分析和后期生物信息的分析。
bioinformatics by Baxevanis 中文版
- 随着人类基因组计划的实施,通过基因组测序,蛋白质序列测定结构解析等实验,分子生物学家提供了大量的有关生物分子的原始数据,需要利用现代计算技术对这些原始数据进行收集、整理、管理以便于检索使用。而为了解释和理解这些数据,还需要对数据进行比对、分析,建立计算模型,进行仿真、预测与验证,因而出现生物信息学,它的出现,极大的促进了分子生物学的发展。-With the human genome project implementation, through genome sequencing, protei
Van der Waals force
- 用于做生物信息的分子与分子之间的力,范得华力
CAUSA
- CAUSA: 基于密码子-氨基酸联合序列比对构建高精确度分子进化树 生物信息学、基因组学(包括功能基因组学和比较基因组学)的主要目的是研究生物基因、蛋白和基因组的结构和功能,并重构生物基因、蛋白和基因组的进化历史。多序列比对(multiple sequence alignment, MSA)是DNA和蛋白质分子进化分析、以及结构与功能研究的基本工具。目前多序列比对已经有很多方法,如clustalw, MUSCLE, MAFFT, T-Coffee, PRANK,等等,但序列比对依然容易产生系统性
clustalw_1.83.orig.tar.gz
- 经典生物信息学多序列比对工具clustalw,采用Feng-Dolittle渐进比对算法,Classic bioinformatics tools for multiple sequence alignment clustalw, using Feng-Dolittle progressive alignment algorithm
clustalx-2.1-win
- 这也是一款很好的多序列比对软件,在生物信息学的应用中很广泛-This is a very good multiple sequence alignment software, the application of bioinformatics is extensively
dyfxxhg
- 用DELPHI写的多元非线性回归代码,对生物统计学和生物信息学有较好参考意义.-With the DELPHI code written in multiple non-linear regression of biological statistics and bioinformatics have good reference value.
informatics
- 生物信息学相关的内容 具体应该是 寻找酶切位点-as for bioinformatics
bowtie-0.12.7-linux-x86_64
- bowtie 生物信息学软件 为二代测序做了不朽的贡献 -owtie used to this tool than a tool to speed fast and good results
weeder1.3.1.tar
- 该程序是基于字符串的模体识别程序,应用于生物信息学。-The program is based on the string motif identification procedures used in bioinformatics.
MSA_MST
- Multiple Sequence Alignment Using Maximum Spanning Tree 生物信息学中一个重要topic:多序列联配。这里用最大生成树的思想来进行联配,算法为C语言实现。本程序在Dev-C++,Win Vista环境下实现。-Multiple Sequence Alignment Using Maximum Spanning Tree Bioinformatics an important topic: Multiple Sequence Alignme
oi
- 聚类和分类技术在生物信息学中的应用,不包含源代码!-Clustering and classification technology in bioinformatics applications, does not contain the source code!
genexp
- Java语言编写的生物信息学综合工具软件,它提供了一个统一的界面调用ncbi-blast、clustalw、几个phylip程序、chromtree和treeview 程序,还提供了多序列比对编辑等其他功能。需要安装Java环境、biojava 1.4p1,2.6M,及以上各个独立程序。-Written in Java language integrated bioinformatics tools, which provides a unified interface called ncbi-