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gromacs-5.1.3.tar
- 分子模拟计算,蛋白,多肽,核酸,适合初学者,有经验论坛,多多讨论(Molecular simulation, protein, polypeptide, nucleic acid)
StressStrain
- 可以在material studio实现应力应变曲线的计算(stress-strain calculation)
利用Fick第二定律求解
- 在皮肤表面经皮给药的过程中,药物分子穿过皮肤的运动机制可以用Fick第二扩散定律等扩散方程来模拟
MS-MD脚本
- MS分子动力学计算perl脚本,实现结构优化等功能(materials studio Perl scr ipt for molecular dynamics calculations)
Lammps使用手册与安装详解
- Lammps是一款操作相对其他分子动力学仿真相对简单的Unix操作平台,由于系统的特殊性与汇编的难度,特整理了一份安装过程与官方中文简章供大家学习。(Lammps is a Unix operating platform with relatively simple operation compared with other molecular dynamics simulation. Due to the particularity of the system and the difficul
流体模拟入门,Robert Bridson
- 涉及到流速、物体力(重力和用户定义的力等)、粘度(分子间的吸引力)、压力(我认为流体分子间的排斥力,也就是不可压缩性)。
环状RNA
- 环状RNA(circRNA)是一类由前体mRNA(pre-mRNA)非规范剪接得到的RNA,具有高度保守性、稳定性。研究发现,circRNA在调控基因表达中扮演重要角色,并与癌症、心血管疾病、糖尿病、阿尔兹海默症等疾病的发生机制密切相关。本文将回顾circRNA的发现历程,介绍circRNA的发生机制、分子特征和生物学功能,并指出其在疾病诊疗方面的前景和未来研究中面临的问题和挑战。
Vector NTI Advance11
- vector nti 破解版在生物数据分析上的使用是非常广泛的,其提供的四个分析模块可以针对DNA、限制酶、引物分析、蛋白质等类型的生物数据进行详细模拟和演化分析,您可以将自己的实验数据加载到软件中,创建一个可以持续分析的实验模拟过程,在不同的实验阶段输入得到的数据,通过掌控数据参数的方式让分子不断进化,从而对未来的生物数据进行预测和判断分析;vector nti advance在序列对比、蛋白质研究、基因分析等方面也是可以使用的,为生物学研究人士提供一个可以计算的实验平台。
HB
- 在materials studio软件统计分子间的氢键数脚本。。。(Statistical hydrogen bond number)
Find minimum energy fcc configuration
- lammps源文件,可以实现计算面心立方晶格的最低能量(find minimum energy fcc configuration)
粗粒化链
- 用lammps的分子模板功能构建粗粒化链,包含lipid.IN dpd.IN(The in file of coarse-grained chain was constructed by molecular template.)
Fe-30-Section
- lammps,30*30*30铁的切15*15*15面,边界条件周期性边界条件,分子动力学MD模拟。(Lammps, MD simulation of iron section)
in
- 该文件利用了分子动力学模拟软件lammps,模拟CuZr合金的弛豫(融化和冷却)。(simulate the melt process of CuZr metallic glasses by lammps)
lammps实例_熔化与凝固
- lammps代码与实例,分子动力学模拟氩、铜和铝的熔化与凝固过程(the codes to simulation the process of the melting of Cu, Al and Ar)
热导率计算
- 樊哲勇老师的分子动力学热导率计算的讲义和lammps脚本。(Professor Fan zheyong's lecture notes and lammps scr ipt of molecular dynamics thermal conductivity calculation.)
1988_小口徑圓柱受不規則波作用時近水面處的波力
- 本文以替代水深代入微小振幅被理論,求得近海水面處*'分子的流速及加速度,再代入 Morison 公式,求得近海水面處桂體所受的虛擬被力,然後利用水面變動修正虛擬波力,求得近海水面處柱體 所受的技力,所推佑的浪力與實測波力相當助合。
word自动求百分比
- 在word表格中,选中的区域,第一列数值为分子,第一列最后一行为分母,求得百分比放入最后一列对应的行中。
lammps学习friction程序
- 高质量的分子动力学建模学习入门,很有用的短期提升。(High quality molecular dynamics modeling learning introduction, very useful for short-term promotion.)
lammps计算热导率
- 计算热导率的常用方法,平衡分子动力学、非平衡分子动力学、lammps
VASP-AIMD-Tutorial6
- VASP-AIMD教程,基本原理和水分子算例(VASP-AIMD tutorial, foundamental theorem and a H2O example)