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DEGREE
- 1、提取原蛋白质相互作用网络的所有节点 2、分别计算原蛋白质相互作用网络每个节点的度 3、从所有节点中选择具有最高度的节点,反复的添加边,直到它的度值等于原蛋白质相互作用网络该节点的度值 4、在为节点添加边时,从剩余节点中选择节点的方法是其度分布近似服从power-low分布 5、令t的值为零,则每个节点被选到的可能性都是相同的,由于在原蛋白质相互作用网络存在大量的低度节点,所以集散节点会优先连接低度节点。 这样创建的网络就为负相关蛋白质互作网络
DNA
- 基因序列比较 人类基因由4种核苷酸,分别用字母ACTG表示。要求编写一个程序,按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度。即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG,它们有多相似呢?测量两个基因的相似度一种方法称为对齐。使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格,让两个基因的长度相等,然后根据基因的分值矩阵计算分数。 A C G T - A 5 -1 -2 -1 -3 C -1 5 -3 -2 -4 G -2 -3 5 -2 -2 T -1 -2 -2 5