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RMSD
- RMSD: Root Mean Square Deviation 是一种在分子模拟及预测中很常见的评价标准，通过Jacobi变换来的到一个大分子和目标分子的相似程度。常用来评价一个三维结构的预测结果是否足够准确.作者主页http://dillgroup.ucsf.edu/~bosco/ 压缩包里的html里还包括有Python代码-RMSD : Root Mean Square Deviation is a molecular simulation and forecasting very
viva
- 经网络提出了一种基于蚁群聚类算法的径向基神经网络. 利用蚁群算法的并行寻优特征和挥发系数方法的自适应更改信息量的能力,并以球面聚类的方式确定了径向基神经网络中基函数的位置, 同时通过比较隐层神经元的相似性、合并相似性较为接近的2 个神经元来约简隐含层的神经元,以达到简化径向-via the Internet presents a clustering algorithm based on the ant colony RBFNN. Ant use the parallel algorithm o
generateROC
- Generates the values in a ROC curve given a similarity matrix. For use in evaluation of biometric recognition systems (e.g. fingerprint, face, iris, etc.)
rna
- rna聚类 将同一个家族的rna按照相似度聚类分组-The same family rna similarity clustering grouped according to similarity
CourseOutline
- Possible measures of similarity: Euclidean distance or cross-correlation between intensity values.
DNA
- 基因序列比较 人类基因由4种核苷酸，分别用字母ACTG表示。要求编写一个程序，按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度。即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG，它们有多相似呢？测量两个基因的相似度一种方法称为对齐。使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格，让两个基因的长度相等，然后根据基因的分值矩阵计算分数。 A C G T - A 5 -1 -2 -1 -3 C -1 5 -3 -2 -4 G -2 -3 5 -2 -2 T -1 -2 -2 5
fastsemsim-0.9.4
- 生物领域利用fastsemsim计算基因本体gene ontology之间的相似性，结果可以衡量不同基因之间的渊源关系。-In the field of biology, fastsemsim is used to calculate the similarity of gene ontology gene ontology, and the results can be used to measure the relationship between different genes.